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不太建议直接删除mysql-bin.00xxxx文件，这些是历史mysql-bin. 二进制日志文件，MySQL会自动清理，多余再手动删比较好。

mysql-bin.00xxxx = MySQL二进制日志 binlog 日志，作用：数据恢复、主从同步、增量备份，存放路径 /www/server/data/ 是宝塔 MySQL 默认数据目录。

设置方法一：
类似缓存文件手动设置保留天数控制：
修改MySQL配置参数：找到 my.cnf，修改expire_logs_days参数，如果没有则增加：
expire_logs_days = 7

这样保留7天binlog，自动过期删除。
如果是MySQL8.0，则是：
binlog_expire_logs_seconds = 604800

604800是7天秒数。

设置方法二：
登录phpMyAdmin，执行SQL：
PURGE BINARY LOGS BEFORE '2026-06-010 23:59:59';

这样可以删除2026-06-10之前所有binlog。

或者删除到某个序号文件：
PURGE BINARY LOGS TO 'mysql-bin.002354';

执行完，MySQL会自动清理对应物理文件，不会破坏mysql-bin.index索引文件。